液体活检在肿瘤监测中的新前景
近年来,液体活检因其侵入性低以及能够实现频繁或连续的样本采集,从而有效跟踪肿瘤进展和治疗反应,备受科学界关注。细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EV)作为细胞释放的一种膜结构,内含多种成分如脂质、蛋白质和RNA,因其真实反映活细胞状态,目前被广泛用于探索生物标志物。
EV-miRNA的诊断潜力
研究显示,EV-miRNA的生物标志物组合在诊断性能方面普遍优于单一标志物,其中EV-miRNA在血浆中的诊断价值亦高于血清。此外,通过对前列腺癌患者尿液中miRNA的差异表达分析,发现10种尿液miRNA可用作前列腺癌早期检测工具。
长链RNA作为新标签
研究表明,血液来源的EV长链RNA表达谱能够显著区分健康个体与恶性肿瘤患者,显示其在胰腺导管腺癌诊断中潜在的生物标志物价值。以往对于cfRNA的研究多采用短读长测序,但该技术在解析全长转录本异构体和复杂RNA加工事件的能力上存在局限。相比之下,cfRNA中的EV RNA完整性较好且长度更长,使用长读长RNA测序技术可以更加准确地分析这些RNA。
创新的COMPLETE-seqRNA流程
来自美国加州大学圣克鲁兹分校的Daniel Kim研究小组意识到长读长测序的优势,专注于利用这一技术进行血液EV RNA检测。研究发现,现有基于DNA的液体活检方法可能会错过癌症的早期阶段。因此,早期诊断是提供有效治疗、降低死亡率的关键。该研究团队采用COMPLETE-seqRNA流程,从血浆中提取EV RNA,利用高特异性的膜亲和技术和硅胶膜柱法,并结合纳米孔长读长技术和短读长技术进行测序,以全面获取EV RNA转录组信息。结果指出,丰富的重复RNA序列可作为疾病特异性诊断生物标志物,这一研究成果已发表在《Nature Biomedical Engineering》期刊上。
cfRNA的特征与应用前景
在该研究中,通过全长cDNA纳米孔测序,研究小组对胰腺癌患者及对照组的血浆样本进行了特征分析,发现cfRNA的长度与以往“短且易降解”的观点截然不同。长读长测序结果显示,mRNA长度可达1,337nt,lncRNA为970nt,揭示了全长、多腺苷酸化的RNA分子的存在。研究表明,TERNA以及其他重复元件RNA在胰腺癌细胞cfRNA中富集,显示出其在疾病检测中的潜力。研究过程利用exoRNeasy试剂盒,确保了提取的EV RNA完整性高,无降解现象。
高效的EV RNA分离方案
exoRNeasy系列试剂盒支持多种大体积样本的处理,使得在短时间内即可高效提取高纯度的总RNA,适用于下游各种RNA的检测与分析。对EV的特异性分离可使用exoEasyMaxiKit,这一过程不需超速离心或沉淀步骤,只需25分钟即可完成。总之,液体活检的前景日益明朗,尤其是细胞外囊泡RNA的应用,有望在临床实践中发挥重大作用。若您对此感兴趣,欢迎联系我们获取更详细的信息,同时了解
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